中心虞文武与柴人杰教授团队在统计与数据科学赋能基因治疗载体设计取得重要进展

发布者:蔡豫晋发布时间:2024-07-24浏览次数:12

腺相关病毒 (AAV) 已被广泛用作基因治疗的载体,工程化 AAV 载体具有提高转导效率、改变载体趋向性、最小化免疫反应和改进制造工艺的潜力。然而,传统的AAV载体工程方法既费时又费力,数据驱动的统计学习方法有望显着提高 AAV 工程工作的智能性和鲁棒性。在这项成果中,通过收集千级的少量有效样本,设计非参数生成式统计学习方法,获得了十万级有效AAV数据库,对比广泛应用的机器学习算法,将开发的统计-机器学习方法,用于预测随机生成的AAV载体转导效率等指标,并通过实验验证证实了其有效性 (1)。该成果成功预测得到了一系列高产量的AAV载体(图2),大大降低了基因治疗的生产成本。


1. 机器学习建模预测AAV产量的模式图



2. 预测并验证高产AAV新载体